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A NCBI (National Center for Biotechnology Information)

O NCBI (National Center for Biotechnology Information) formou-se em 1988 nos Estados Unidos da América sendo um recurso nacional no que respeita à informação disponível na área da Biologia Molecular. O NCBI cria bases de dados públicas, conduz investigação em biologia computacional, desenvolve software para análise de dados genómicos e dissemina a informação biomédica. Desde 1992 que o NCBI assumiu a responsabilidade da GenBank , uma famosa base de dados de sequências de DNA de importância crucial para a Biologia Molecular. Esta base de dados, financiada pelo National Institute of Health (NIH), foi construída com base em sequências de nucleótidos submetidas por laboratórios de investigação incluíndo dados trocados com outras bases de dados internacionais de sequências de nucleótidos, como seja o EMBL (European Molecular Biology Laboratory) e da DDBJ (DNA Database of Japan).

São disponibilizados pelo NCBI outras ferramentas de software, entre elas a ferramenta ORF Finder (para encontrar uma grelha de leitura aberta – Open Reading Frame), ou, dito de outra forma, de um gene. Neste portal e-escola, são dados exemplos de como usar esta ferramenta e encontrar a sequência de nucleótidos de um determinado gene e a sequência de aminoácidos por este codificada. Uma outra das ferramentas mais conhecidas disponibilizada pelo NCBI é o programa BLAST. Este foi desenvolvido no NCBI para a pesquisa de semelhança entre sequências de nucleótidos. É um programa instrumental para identificação de genes e de sequências genéticas características. Consegue ainda executar pesquisa de sequências contra a base de dados de DNA completa em menos de 15 segundos! (saber mais). Neste portal de ensino e-escola é também exemplificado o uso do programa BLAST, onde se usa o BLAST e se procuram as sequências hómologas com os genes responsáveis pela biossíntese do polissacárido cepaciano (saber mais)

Sub-Temas e Tópicos

• • Pesquisa da sequência de um gene e da proteína codificada

    Grupo de Ciências Biológicas do IST | 18/11/2005 | Intermédio